1. Về hạn mức chỉ định thầu trong thời gian quá độ (từ 01/7/2014 đến 15/8/2014)
Nội dung này đã nêu trong văn bản 4054 (có dẫn chiếu đến khoản 1 Điều 129 NĐ 63). Theo đó, đối với các gói thầu có HSYC phát hành trong khoảng thời gian từ 01/7/2014 đến trước ngày 15/8/2014 thì thực hiện theo Luật 43 và NĐ 85. Luật 43 chưa quy định hạn mức chỉ định thầu, vì vậy các gói thầu có HSYC phát hành trong khoảng thời gian này vẫn được áp dụng hạn mức chỉ định thầu theo quy định của NĐ 85.
2. Về áp dụng phương thức lựa chọn nhà thầu
Theo quy định của Luật 43 thì các gói thầu MSHH, XL không phải là quy mô nhỏ phải áp dụng phương thức 1 giai đoạn 2 túi hồ sơ. Tuy nhiên trong NĐ 85 không có quy định về quy trình lựa chọn nhà thầu đối với các gói thầu MSHH, XL áp dụng phương thức 1 giai đoạn 2 túi hồ sơ. Vì vậy đối với các gói thầu XL, MSHH (không phụ thuộc vào giá trị của gói thầu) có thời gian phát hành HSMT trước ngày 15/8/2014 thì vẫn được áp dụng phương thức 1 giai đoạn 1 túi hồ sơ.
3. Về đăng ký thông tin nhà thầu trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia
Theo quy định tại điểm d khoản 1 Điều 5 Luật đấu thầu 43 thì nhà thầu tham dự thầu được đánh giá là có tư cách hợp lệ khi đã đăng ký trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia. Vậy từ ngày 01/7/2014 nhà thầu chưa đăng ký trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia có bị loại do không đáp ứng điều kiện tiên quyết hay không?
NĐ63 (khoản 5 Điều 129) đã giao cho Bộ KHĐT chịu trách nhiệm quy định lộ trình áp dụng và hướng dẫn chi tiết thực hiện nội dung "Đăng ký thông tin nhà thầu trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia theo quy định tại Điểm d Khoản 1 Điều 5 và Điểm e Khoản 2 Điều 22 của Luật Đấu thầu số 43/2013/QH13". Hiện nay, Bộ KHĐT chưa có hướng dẫn cũng như lộ trình áp dụng đối với nội dung này. Vì vậy, cho đến khi Bộ KHĐT có văn bản hướng dẫn thì nhà thầu tham dự thầu không nhất thiết phải có tên trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia.