Giao dịch giữa chủ đầu tư và nhà thầu là người mua và người bán. Vấn đề về phương pháp tính thuế, hóa đơn chứng từ....Điều 9,10,11 trong luật thuế giá trị gia tăng đã quy định. Vì vậy nếu là hoạt động xây dựng hay là lắp đặt thì trước khi thanh toán, nhà thầu phải xuất hóa đơn cho người mua theo luật định, mục đích cũng là để có cơ sở khấu trừ thuế sau này. Do vậy, các điều khoản trong hợp đồng thi công xây lắp hay hợp đồng cung cấp, lắp đặt thiết bị giữa nhà thầu và chủ đầu tư....thường quy định rất rõ ràng trong mục "phương thức thanh toán" về vấn đề này.