Có mấy văn bản sau khá hữu ích:
- Thông tư 32/2007/TT-BTC Khẳng định lại miễn thuế VAT với dự án ODA không hoàn lại
- Thông tư 41/2002/TT-BTC thuế đối với ODA
- Công văn 7711/TC/TCT ngày 13/7/2004
Đối với dự án ODA không hoàn lại thì khá rõ. Còn đối với ODA hoàn lại (vay) thì giữa các dự án không giống nhau. Có thể là tùy thuộc hiệp định vay (nhưng thường hiệp định vay không quy định chi tiết lắm).
Nói chung bạn có 2 cách lựa chọn: Giá HĐ có thuế VAT; hoặc Giá HĐ không có thuế VAT
Thông thường, HSMT nên quy định rõ là Giá hợp đồng không bao gồm Thuế VAT; nhà thầu tự lo hoàn thuế theo các quy định hiện hành. Nếu Hồ sơ Mời thầu quy định Giá hợp đồng có thuế VAT thì sau này chủ đầu tư phải chạy theo rất mệt (nhưng cũng có cửa cho Chủ đầu tư kiếm chác
)
Nhưng lưu ý là khi lập Tổng dự toán, bạn phải dành một khoản tiền, gọi là: "Vốn đối ứng hoàn thuế (VAT, Thuế Nhập khẩu, ....). Nếu không thì Nhà thầu không hoàn thuế được. Khoản tiền này sẽ không cấp cho Chủ đầu tư, mà dùng để bù trừ thuế (trên giấy tờ) theo thông tư 41.